Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAPD7Q5XG87 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms