Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms