Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms