Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms