Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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