Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms