Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms