Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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