Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOMO3P69849 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOMO3P69849 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOMO3P69849 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms