Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms