Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LMO4P61968 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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