Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MYCNOSP40205 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MYCNOSP40205 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms