Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms