Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms