Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD247P20963 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD247P20963 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms