Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SFTPCP11686 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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