Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms