Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB3P05106 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms