Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFNB1P01574 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFNB1P01574 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms