Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms