Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACSL4O60488 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACSL4O60488 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACSL4O60488 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ACSL4O60488 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ACSL4O60488 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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