Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms