Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms