Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A4Q9Y6R1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC4A4Q9Y6R1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms