Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDY1Q9Y6F8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDY1Q9Y6F8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms