Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPG1Q9Y678 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPG1Q9Y678 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms