Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPQQ9Y646 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms