Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCYT1BQ9Y5K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms