Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF3AQ9Y496 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF3AQ9Y496 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF3AQ9Y496 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms