Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL2Q9Y467 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL2Q9Y467 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL2Q9Y467 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms