Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
KNSTRNQ9Y448 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KNSTRNQ9Y448 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms