Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms