Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3HCC1Q9Y3T6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms