Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF13Q9Y2Y9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF13Q9Y2Y9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms