Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFR3BQ9Y2G0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms