Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC4Q9Y296 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC4Q9Y296 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC4Q9Y296 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms