Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1AQ9Y294 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1AQ9Y294 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms