Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF3LQ9Y262 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3LQ9Y262 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms