Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNEQ9Y223 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms