Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2BQ9UQN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms