Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4E1Q9UPM8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms