Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CIZ1Q9ULV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CIZ1Q9ULV3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CIZ1Q9ULV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms