Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PALD1Q9ULE6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms