Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RARRES3Q9UL19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms