Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA11Q9UKX5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA11Q9UKX5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms