Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PILRAQ9UKJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PILRAQ9UKJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms