Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3LQ9UJW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms