Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HACL1Q9UJ83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACL1Q9UJ83 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACL1Q9UJ83 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms