Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT1Q9UHJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT1Q9UHJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms