Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFDP1Q9UEE9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CFDP1Q9UEE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CFDP1Q9UEE9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms